Základný a aplikovaný výskum v UVP BIOMED je zameraný na spoločensky najzávažnejšie ochorenia, akými sú rakovina, poruchy srdcovocievneho systému, cukrovka, obezita,   autoimunitné poruchy, neurologické a infekčné choroby. Výskum sa okrem iného zameriava aj na využitie pokročilých terapií napr. pomocou kmeňových buniek, či na vývoj  najmodernejších diagnostických postupov.